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半定量RT-PCR的实验步骤介绍
点击次数:568 更新时间:2023-02-10
    半定量RT-PCR将以RNA为模板的cDNA合成同PCR结合在一起,提供了一种分析基因表达的快速灵敏的方法。RT-PCR用于对表达信息进行检测或定量。另外,这项技术还可以用来检测基因表达差异或不必构建cDNA文库克隆cDNA。RT-PCR比其他包括Northern印迹、RNase保护分析、原位杂交及S1核酸酶分析在内的RNA分析技术,更灵敏,更易于操作。
  RT-PCR的模板可以为总RNA或poly(A)+选择性RNA。逆转录反应可以使用逆转录酶,以随机引物、oligo(dT)或基因特异性的引物(GSP)起始。RT-PCR可以一步法或两步法的形式进行。在两步法RT-PCR中,每一步都在最佳条件下进行。cDNA的合成首先在逆转录缓冲液中进行,然后取出1/10的反应产物进行PCR。在一步法RT-PCR中,逆转录和PCR在同时为逆转录和PCR优化的条件下,在一只管中顺次进行。
  实验步骤:
  Trizol法RNA提取步骤
  1、提取总RNA
  2、逆转录反应
  3、PCR反应
  以下实验步骤仅供参考:
  1样品RNA的抽提
  ①取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其溶解。
  ②两相分离
  每1ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2ml的lv仿,盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12000rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的红色酚lv仿相,中间层以及无色水相上层。RNA全部被分配于水相中。水相上层的体积大约是匀浆时加入的TRIZOL试剂的60%。
  ③RNA沉淀
  将水相上层转移到一干净无RNA酶的离心管中。加等体积yi丙醇混合以沉淀其中的RNA,混匀后15到30℃孵育10分钟后,于4℃下12000rpm
  离心10分钟。此时离心前不可见的RNA沉淀将在管底部和侧壁上形成胶状沉淀块。
  ④RNA清洗
  移去上清液,每1mlTRIZOL试剂裂解的样品中加入至少1ml的75%乙醇(75%乙醇用DEPCH2O配制),清洗RNA沉淀。混匀后,4℃下7000rpm离心5分钟。
  ⑤RNA干燥小心吸去大部分乙醇溶液,使RNA沉淀在室温空气中干燥5-10分钟。
  ⑥溶解RNA沉淀
  溶解RNA时,先加入无RNA酶的水40μl用枪反复吹打几次,使其溶解,获得的RNA溶液保存于-80℃待用。

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